結(jié)核桿菌(TB)熒光PCR核酸擴(kuò)增檢測試劑盒說明書
【產(chǎn)品名稱】
通用名稱:結(jié)核桿菌(TB)核酸檢測試劑盒(熒光-PCR法)
Name :Tubercle Bacillus Detection Kit (Real-Time PCR Method)
【包裝規(guī)格】48T/盒
【預(yù)期用途】
4.1結(jié)核病是由結(jié)核桿菌(Tubercle bacillus, TB)引起的傳染性疾病,可累及全身多個器官,但以肺結(jié)核為常見。據(jù)世界衛(wèi)生組織報(bào)道,*有超過三分之一的人口被致病菌結(jié)核分枝桿菌所感染,其中約10%的人們在其有生之間將面臨活動性結(jié)核病的困擾[1]。而在這些結(jié)核病患者中,每年有200萬人喪生。雖然有抗菌藥物,但其療程至少要6個月,且花費(fèi)巨大,由于經(jīng)濟(jì)等原因而常常使患者無以為繼[2]。本試劑盒適用于檢測人氣管分泌物拭子、肺組織等樣本中的結(jié)核桿菌,用于結(jié)核桿菌感染的輔助診斷。
【檢驗(yàn)原理】
本試劑盒采用TaqMan探針法實(shí)時熒光PCR技術(shù),設(shè)計(jì)一對結(jié)核桿菌特異性引物,結(jié)合一條特異性探針,用熒光PCR技術(shù)對結(jié)核桿菌的核酸進(jìn)行體外擴(kuò)增檢測,用于臨床上對可疑感染者的病原學(xué)診斷。
【試劑組成】
名 稱 規(guī) 格
核酸提取液 1.5mL×2管
酶液 50μL×1管
TB反應(yīng)液 1.0mL×1管
TB陽性質(zhì)控品 50μL×1管
陰性質(zhì)控品 250μL×1管
注:
1)不同批號試劑不能混用。
2)試劑盒內(nèi)各試劑組份足夠包裝規(guī)格所標(biāo)示的檢測次數(shù)。
【儲存條件及有效期】
-20℃±5℃,避光保存、運(yùn)輸、反復(fù)凍融次數(shù)不超過5次,有效期12個月。
【適用儀器】
ABI 、安捷倫MX3000P/3005P、LightCycler、Bio-Rad、eppendorf等系列熒光定量PCR檢測儀。
【標(biāo)本采集】
無菌采集人肺病變部位或病變/非病變部位交界處的樣品;或用滅菌棉拭子沾取人氣管分泌物,放入無菌試管中。
【保存和運(yùn)輸】
上述標(biāo)本短期內(nèi)可保存于-20℃,長期保存可置-70℃,但不能超過6個月,標(biāo)本運(yùn)送應(yīng)采用2~8℃冰袋運(yùn)輸,嚴(yán)禁反復(fù)凍融。
【使用方法】
1.樣品處理(樣本處理區(qū))
1.1樣本前處理
組織樣品:每份組織分別從3個不同的位置稱取樣品約1g,手術(shù)剪剪碎混勻后取0.5g于研磨器中研磨,加入1.5mL生理鹽水后繼續(xù)研磨,待勻漿后轉(zhuǎn)至1.5mL滅菌離心管中,8000rpm離心2min,取上清液100μL于1.5mL滅菌離心管中;氣管分泌物取100μL提取。
1.2DNA提取
1)對上述處理好的標(biāo)本加入等體積核酸提取液(固體標(biāo)本加入50μL核酸提取液),100℃恒溫處理10min,13,000 rpm離心5min,取上清液轉(zhuǎn)移至新的1.5mL EP管,-20℃保存;
2)DNA的提取也可以采用上海晅科生物科技股份有限公司生產(chǎn)的DNA提取試劑盒(離心柱提取法),請嚴(yán)格按照試劑盒說明書進(jìn)行操作。
2.試劑配制(試劑準(zhǔn)備區(qū))
根據(jù)待檢測樣本總數(shù),設(shè)所需要的PCR反應(yīng)管管數(shù)為N(N=樣本數(shù)+1管陰性對照+1管陽性對照;樣品每滿7份,多配制1份),每測試反應(yīng)體系配制如下表:
試劑 TB反應(yīng)液 酶液
用量(樣本數(shù)為N) 20μL 1μL
將混合好的測試反應(yīng)液分裝到PCR反應(yīng)管中,21uL/管。
3.加樣(樣本處理區(qū))
將步驟1提取的DNA、陽性質(zhì)控品、陰性質(zhì)控品各取4μL,分別加入相應(yīng)的反應(yīng)管中,蓋好管蓋,混勻,短暫離心。
4.PCR擴(kuò)增(核酸擴(kuò)增區(qū))
4.2將待檢測反應(yīng)管置于熒光定量PCR儀反應(yīng)槽內(nèi);
4.3設(shè)置好通道、樣品信息,反應(yīng)體系設(shè)置為25μL;
熒光通道選擇: 檢測通道(Reporter Dye)FAM, 淬滅通道(Quencher Dye)NONE,ABI系列儀器請勿選擇ROX參比熒光,選擇None即可。
4.4推薦循環(huán)參數(shù)設(shè)置:
步驟 循環(huán)數(shù) 溫度 時間 收集熒光信號
1 1 cycle 95℃ 10min 否
2 40 cycles 94℃ 15sec 否
55℃ 30sec 是
5.結(jié)果分析判定
5.1結(jié)果分析條件設(shè)定
設(shè)置Baseline和Threshold:一般直接按機(jī)器自動分析的結(jié)果分析,當(dāng)曲線出現(xiàn)整體傾斜時,根據(jù)分析后圖像調(diào)節(jié)Baseline的start值(一般可在3~15范圍內(nèi)調(diào)節(jié))、stop值(一般可在5~20范圍內(nèi)調(diào)節(jié)),以及Threshold的Value值(上下拖動閾值線至高于陰性對照),重新分析結(jié)果。
5.2結(jié)果判斷
陽性:檢測通道Ct值≤35.0,且明顯的擴(kuò)增曲線。
可疑:檢測通道Ct值>35.0,且出現(xiàn)明顯曲線的樣本建議重復(fù)試驗(yàn),重復(fù)試驗(yàn)結(jié)果如果同樣出現(xiàn)Ct值≤35.0和明顯擴(kuò)增曲線則為陽性,否則為陰性。
陰性:樣本檢測結(jié)果無Ct值且無明顯的擴(kuò)增曲線。
6. 檢測方法的局限性
1)樣本檢測結(jié)果與樣本收集、處理、運(yùn)送以及保存質(zhì)量有關(guān);
2)樣本提取過程中沒有控制好交叉污染,會出現(xiàn)假陽性結(jié)果;
3)陽性對照、擴(kuò)增產(chǎn)物泄漏,會導(dǎo)致假陽性結(jié)果;
4)病原體在流行過程中基因突變、重組,會導(dǎo)致假陰性結(jié)果;
5)不同的提取方法存在提取效率差異,會導(dǎo)致假陰性結(jié)果;
6)試劑運(yùn)輸,保存不當(dāng)或試劑配制不準(zhǔn)確引起的試劑檢測效能下降,出現(xiàn)假陰性或定量檢測不準(zhǔn)確的結(jié)果;
7)本檢測結(jié)果僅供參考,如須確診請結(jié)合臨床癥狀以及其他檢測手段。
7.質(zhì)控標(biāo)準(zhǔn)
陰性質(zhì)控品:無明顯擴(kuò)增曲線或無Ct值顯示;
陽性質(zhì)控品:擴(kuò)增曲線有明顯指數(shù)生長期,且Ct值≤32;
以上條件應(yīng)同時滿足,否則實(shí)驗(yàn)視為無效。
【注意事項(xiàng)】
1.所有操作嚴(yán)格按照說明書進(jìn)行;
2.試劑盒內(nèi)各種組分使用前應(yīng)自然融化,*混勻并短暫離心;
3.反應(yīng)液應(yīng)避光保存;
4.反應(yīng)中盡量避免氣泡存在,管蓋需蓋緊;
5.使用一次性吸頭、一次性手套和各區(qū)工作服;
6.樣本處理、試劑配制、加樣需在不同區(qū)進(jìn)行,以免交叉污染;
7.實(shí)驗(yàn)完畢后用 10%次氯酸或 75%酒精或紫外燈處理工作臺和移液器;
8.試劑盒里所有物品應(yīng)視為污染物對待,并按照《微生物生物醫(yī)學(xué)實(shí)驗(yàn)室生物安全通則》進(jìn)行處理。
【參考文獻(xiàn)】
Ø[1] Anon, W. H. O. (2006). Global Tuberculosis Control, Surveillance, Planning, Financing. Geneva: WHO, 1-242.
Ø[2] Russell, D. G. (2007). Who puts the tubercle in tuberculosis? Nat Rev Microbiol 5, 39-47.
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