偽狂犬病毒通用型(PRV-gB)熒光PCR試劑盒說明書
【產品名稱】
通用名稱:偽狂犬病毒通用型(PRV-gB)核酸檢測試劑盒(熒光-PCR 法)
Name :Pseudorabies Virus gB gene Detection Kit (Real-Time PCR Method)
【包裝規(guī)格】48T/盒
【預期用途】
偽狂犬病病毒(Pseudorabies virus,PRV)又稱豬皰疹病毒Ⅰ型、傳染性延髓麻痹病毒、奇癢癥病毒、奧葉茲基氏病病毒。是引起牛、羊、豬、犬和貓等多種家畜和野生動物發(fā)熱、奇癢(豬除外)及腦脊髓炎為主要癥狀的皰疹病毒[1]。豬是偽狂犬病的自然宿主,對其危害大。可致妊娠母豬流產,產死胎及胎兒干尸化。對初生仔豬則引起神經癥狀,出現(xiàn)運動失調,麻痹,衰竭死亡,病死率 100%。成年豬多呈隱性感染,但可引起呼吸道癥狀[2]。病豬、帶毒豬及帶毒鼠類是本病的主要傳染源,病毒主要從病豬的鼻分泌物、唾液、乳汁和尿中排除,有的帶毒豬可持續(xù)排毒一年。
本試劑盒利用實時熒光 PCR 原理,檢測偽狂犬病毒,對偽狂犬病毒引起的疾病及其并發(fā)癥的診斷及療效評估有重要指導意義。
【檢驗原理】
本試劑盒針對偽狂犬病毒gB基因高度保守區(qū)基因序列設計特異性引物和熒光探針[3]。在反應體系中含偽狂犬病毒gB基因組模板的情況下,PCR反應得以進行并釋放 熒光信號。利用熒光定量PCR儀對PCR過程中相應通道的信號強度進行實時監(jiān)測和輸出,實現(xiàn)檢測結果的定性、定量分析。
【試劑組成】
名 稱 規(guī) 格
核酸提取液 1.5mL×2 管
酶液 50μL×1 管
PRV-gB 反應液 1.0mL×1 管
PRV-gB 陽性質控品 50μL ×1 管
陰性質控品 250μL ×1 管
注:
1)丌同批號試劑丌能混用。
2)試劑盒內各試劑組份足夠包裝規(guī)格所標示的檢測次數(shù)。
【儲存條件及有效期】
-20℃±5℃,避光保存、運輸、反復凍融次數(shù)丌超過 5 次,有效期 12 個月。
【適用儀器】
ABI 、安捷倫 MX3000P/3005P、LightCycler、Bio-Rad、Eppendorf 等系列熒光定量 PCR 檢測儀。
【標本采集】
病死或撲殺的豬,取腦、淋巴結、脾臟、肺臟等組織;待檢活豬,用棉拭子取鼻腔分泌物、唾液、乳汁等,置于 50%甘油生理鹽水中,或用注射器取血 5mL。
【保存和運輸】
上述標本短期內可保存于-20℃,長期保存可置-70℃,但丌能超過 6 個月,標本運送應采用 2~8℃冰袋運輸,嚴禁反復凍融。
【使用方法】
1.樣品處理(樣本處理區(qū))
1.1樣本前處理
組織樣品:每份組織分別從 3 個丌同的位置稱取樣品約 1g,手術剪剪碎混勻后取
0. 5g 于研磨器中研磨,加入 1.5mL 生理鹽水后繼續(xù)研磨,待勻漿后轉至 1.5mL 滅菌離心管中,8000rpm 離心 2min,取上清液 100μL 于 1.5mL 滅菌離心管中;分泌物棉拭子直接取 100μL 提??;血液取血清 100μL 提取。
1.2DNA 提取
1)對上述處理好的標本加入 50μL 核酸提取液,100℃恒溫處理 10min,13,000
rpm 離心 5min,取上清液轉移至新的 1.5mL EP 管,-20℃保存;
2)DNA 的提取也可以采用上海晅科生物科技有限公司生產的 DNA 提取試劑盒
(離心柱提取法),請按照試劑盒說明書進行操作。
2.試劑配制(試劑準備區(qū))
根據(jù)待檢測樣本總數(shù),設所需要的 PCR 反應管管數(shù)為 N(N=樣本數(shù)+1 管陰性對照+1 管陽性對照;樣本總數(shù)每滿 7 份,則多配制 1 頭份 PCR 反應液),單個測試反應液體系配制如下表:
試劑 PRV-gB 反應液 酶液
用量(樣本數(shù)為 N) 20μL 1μL
將混合好的測試反應液分裝到 PCR 反應管中,21uL/管。
3.
加樣(樣本處理區(qū))
將步驟 1 提取的 DNA、陽性質控品、陰性質控品各取 4μL,分別加入相應的反應管中,蓋好管蓋,混勻,短暫離心。
4.PCR 擴增(核酸擴增區(qū))
4.1將待檢測反應管置于熒光定量 PCR 儀反應槽內;
4.2設置好通道、樣品信息,反應體系設置為 25μL;
熒光通道選擇: 檢測通道(Reporter Dye)FAM, 淬滅通道(Quencher Dye)
NONE,ABI 系列儀器請勿選擇 ROX 參比熒光,選擇 None 即可。
4.3推薦循環(huán)參數(shù)設置:
步驟 循環(huán)數(shù) 溫度 時間 收集熒光信號
1 1 cycle 95℃ 10min 否
2 40 cycles 94℃ 15sec 否
55℃ 30sec 是
5.結果分析判定
5.1結果分析條件設定
設置 Baseline 和 Threshold:一般直接按機器自動分析的結果分析,當曲線出現(xiàn)整體傾斜時,根據(jù)分析后圖像調節(jié) Baseline 的start 值(一般可在 3~15 范圍內調節(jié))、
stop 值(一般可在 5~20 范圍內調節(jié)),以及 Threshold 的 Value 值(上下拖動閾值線至高于陰性對照),重新分析結果。
5.2結果判斷
陽性:檢測通道 Ct 值≤35.0,丏明顯的擴增曲線。
可疑:檢測通道 Ct 值>35.0,丏出現(xiàn)明顯曲線的樣本建議重復試驗,重復試驗結果如果同樣出現(xiàn) Ct 值≤35.0 和明顯擴增曲線則為陽性,否則為陰性。
陰性:樣本檢測結果無 Ct 值丏無明顯的擴增曲線。
6.質控標準
陰性對照:無明顯擴增曲線或無 Ct 值顯示;
陽性對照:擴增曲線有明顯指數(shù)生長期,丏 Ct 值≤32; 以上條件應同時滿足,否則實驗視為無效。
7.檢測方法的局限性
Ø樣本檢測結果不樣本收集、處理、運送以及保存質量有關;
Ø樣本提取過程中沒有控制好交叉污染,會出現(xiàn)假陽性結果;
Ø陽性對照、擴增產物泄漏,會導致假陽性結果;
Ø病原體在流行過程中基因突變、重組,會導致假陰性結果;
Ø丌同的提取方法存在提取效率差異,會導致假陰性結果;
Ø試劑運輸,保存丌當或試劑配制丌準確引起的試劑檢測效能下降,出現(xiàn)假陰性或定量檢測丌準確的結果;
【注意事項】
Ø所有操作嚴格按照說明書進行;
Ø試劑盒內各種組分使用前應自然融化,*混勻并短暫離心;
Ø反應液應避光保存;
Ø反應中盡量避免氣泡存在,管蓋需蓋緊;
Ø使用一次性吸頭、一次性手套和各區(qū)與用工作服;
Ø樣本處理、試劑配制、加樣需在不同區(qū)進行,以免交叉污染;
Ø實驗完畢后用 10%次氯酸或 75%酒精或紫外燈處理工作臺和移液器;
Ø試劑盒里所有物品應視為污染物對待,并按照《微生物生物醫(yī)學實驗室生物安全通則》進行處理。
【參考文獻】
[1]婁高明,杜偉賢.偽狂犬病流行概況及豬場防制策略[J].中國動物檢疫,1999, 16(5):43-45.
[2]殷震,劉景華.動物病毒學[M].北京:科學出版社,1997.
[3]朱淑芬,朱瑞良,喬彩霞.檢測偽狂犬病毒gB基因熒光定量PCR方法的建立[J].中國獸醫(yī)學報,2012,32(10):1413-1417.
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