艱難梭菌(CD)熒光PCR核酸擴增檢測試劑盒說明書
【產(chǎn)品名稱】
通用名稱:艱難梭菌 (CD)核酸擴增檢測試劑盒(PCR 熒光探針法)
Name :Diagnostic Kit for Clostridium difficile DNA(PCR Fluorescence Probing)
【包裝規(guī)格】48T/盒
【預期用途】
本試劑盒適用于檢測水樣糞便等樣本中的艱難梭菌,用于艱難梭菌感染的輔助診斷,其檢測結果僅供參考。
【檢驗原理】
本試劑盒采用 TaqMan 探針法實時熒光 PCR 技術,設計一對艱難梭菌特異性引物,結合一條特異性探針,用熒光PCR 技術對艱難梭菌的核酸進行體外擴增檢測, 用于臨床上對可疑感染者的病原學診斷。
【試劑組成】
說明:不同批號的試劑盒組分不可交互使用。
【儲存條件及有效期】
-20℃±5℃,避光保存、運輸、反復凍融少于 7 次,有效期 12 個月。
【適用儀器】
ABI 、安捷倫 MX3000P/3005P、LightCycler、Bio-Rad、eppendorf 等系列熒光定量 PCR 檢測儀。
【標本采集】
取水樣便 0.5~1mL
【保存和運輸】
上述標本短期內(nèi)可保存于-20℃,長期保存可置-70℃,但不能超過 6 個月,標本運送應采用 2~8℃冰袋運輸,嚴禁反復凍融。
【使用方法】
1. 樣品處理(樣本處理區(qū))
1.1 樣本前處理
13000rpm 離心 2min,去盡上清
1.2 DNA 提取
1) 對上述處理好的標本加入等體積核酸提取液(固體標本加入50μL核酸提取液), 100℃恒溫處理 10min,13,000 rpm 離心 5min,取上清液轉移至新的 1.5mL EP 管,-20℃保存;
2) DNA 的提取也可以采用上海晅科生物科技有限公司生產(chǎn)的DNA提取試劑盒(離心柱提取法),請嚴格按照試劑盒說明書進行操作。
2. 試劑配制(試劑準備區(qū))
根據(jù)待檢測樣本總數(shù),設所需要的PCR 反應管管數(shù)為N(N=樣本數(shù)+1 管陰性對照+1 管陽性對照;樣品每滿 7 份,多配制 1 份),每測試反應體系配制如下表:
3. 加樣(樣本處理區(qū))
將步驟 1 提取的 DNA、陽性質控品、陰性質控品各取 4μL,分別加入相應的反應管中,蓋好管蓋,混勻,短暫離心。
4. PCR 擴增(核酸擴增區(qū))
4.1 將待檢測反應管置于熒光定量 PCR 儀反應槽內(nèi);
4.2 設置好通道、樣品信息,反應體系設置為 25μL;
熒光通道選擇: 檢測通道(Reporter Dye)FAM, 淬滅通道(Quencher Dye)NONE,請勿選擇 ROX 參比熒光。
5. 結果分析判定
5.1 結果分析條件設定
設置 Baseline 和 Threshold:一般直接按機器自動分析的結果分析,當曲線出現(xiàn)整體
傾斜時,根據(jù)分析后圖像調節(jié)Baseline 的 start 值(一般可在 3~15 范圍內(nèi)調節(jié))、stop
值(一般可在 5~20 范圍內(nèi)調節(jié)),以及 Threshold 的 Value 值(上下拖動閾值線至高于陰性對照),重新分析結果。
5.2 結果判斷
陽性:檢測通道 Ct 值≤35.0,且曲線有明顯的指數(shù)增長曲線。
可疑:檢測通道 Ct 值>35.0,且出現(xiàn)典型擴增曲線的樣本建議重復試驗,重復試驗
結果出現(xiàn) Ct 值≤35.0 和典型擴增曲線者為陽性,否則為陰性。
陰性:樣本檢測結果無 Ct 值且無明顯的擴增曲線。
6. 檢測方法的局限性
1)樣本檢測結果與樣本收集、處理、運送以及保存質量有關;
2)樣本提取過程中沒有控制好交叉污染,會出現(xiàn)假陽性結果;
3)陽性對照、擴增產(chǎn)物泄漏,會導致假陽性結果;
4)病原體在流行過程中基因突變、重組,會導致假陰性結果;
5)不同的提取方法存在提取效率差異,會導致假陰性結果;
6)試劑運輸,保存不當或試劑配制不準確引起的試劑檢測效能下降,出現(xiàn)假陰性或定量檢測不準確的結果;
7)本檢測結果僅供參考,如須確診請結合臨床癥狀以及其他檢測手段。
7. 質控標準
陰性質控品:無明顯擴增曲線或無 Ct 值顯示;
陽性質控品:擴增曲線有明顯指數(shù)生長期,且 Ct 值≤32; 以
上條件應同時滿足,否則實驗視為無效。
8. 產(chǎn)品性能指標
陰陽性參考品符合率:5 份陽性參考品符合率為 100%;10 份陰性參考品符合率為
100%。
低檢測限:1.0×10 3copies/mL。
精密度:批內(nèi)、批間精密度檢測 Ct 值的變異系數(shù)(CV)均小于等于 3%。
【注意事項】
1)所有操作嚴格按照說明書進行;
2)試劑盒內(nèi)各種組分使用前應自然融化,*混勻并短暫離心;
3)反應液應避光保存;
4)反應中盡量避免氣泡存在,管蓋需蓋緊;
5)使用一次性吸頭、一次性手套和各區(qū)工作服;
6)樣本處理、試劑配制、加樣需在不同區(qū)進行,以免交叉污染;
7)實驗完畢后用 10%次氯酸或 75%酒精或紫外燈處理工作臺和移液器;
8)試劑盒里所有物品應視為污染物對待,并按照《微生物生物醫(yī)學實驗室生物安全 通則》進行處理。
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